Η ανάπτυξη σύγχρονων εκπαιδευτικών δομών σε κεντρικό ή περιφερειακό επίπεδο προϋποθέτει λειτουργίες με βάση την αντίληψη ότι κάθε εκπαιδευτική δομή πρέπει να λειτουργεί ως αυτόνομη μονάδα (Language Development Studies). Με αυτό το σκεπτικό προχωρήσαμε στην οργάνωση του εκπαιδευτηρίου μας με την βοήθεια τόσο της Ευρωπαϊκής εμπειρίας όσο και των τοπικών αναγκών. Ακολουθούμε τα πρότυπα του EQUALS και αντιλαμβανόμαστε την λειτουργία του εκπαιδευτηρίου ως ένα αυτόνομο κύτταρο εκπαίδευσης. Λειτουργούμε στο πλαίσιο της "δημοκρατικής ανάπτυξης" όπου οι συνεργάτες-καθηγητές έχουν την ευθύνη για την πραγματοποίηση των κοινών στόχων που συναποφασίζουμε.
Σχηματικά η οργάνωση του εκπαιδευτήριου μας μπορεί να παρασταθεί:
Ακολουθώντας πιστά και με συνεχής βελτιώσεις αυτό το μοντέλο έχουμε την δυνατότητα να παρακολουθούμε την εξέλιξη της αλληλεπίδρασης ανάμεσα στα ενδιαφερόμενα μέλη. Κλειδί για την ομαλή λειτουργία του εκπαιδευτηρίου είναι η συνεχής αξιολόγηση και η επικοινωνία των ενδιαφερομένων μελών.